三層瓦楞紙箱在垂直于紙面方向上具有一定彈性，對包裝物有緩沖減震作用。這是廣泛應用三層瓦楞紙箱制造包裝箱的主要原因，但是這種彈性卻給印刷帶來一定的難度。柔性印版因為是由合成橡膠或樹脂作為主體，在印刷過程中能以本身的壓縮彈性變形來彌補瓦楞紙的厚薄誤差與表面不平，從而滿足每張三層瓦楞紙箱的壓印要求，墨色比較均勻。柔性版印刷使用網紋輥短墨路傳墨系統和水性油墨，紙張由纖維交織而成，其親水性要比親油性好，所以只要輕輕接觸三層瓦楞紙箱，水性墨就幾乎全部被三層瓦楞紙箱吸收，因此墨色均勻、平服、厚實。

柔性版印刷是使用柔性印版，通過網紋傳墨輥傳遞油墨的方法進行印刷。印刷時網紋輥將一定厚度的油墨層均勻地涂布在印版圖文部分，然后在壓印滾筒壓力的作用下，圖文部分的油墨層轉移到承印物的表面，形成清晰的圖文。柔性版三層瓦楞紙箱印刷機的輸墨機構通常是兩輥式輸墨機構。

直接印刷的工藝流程為：三層瓦楞紙箱的生產一紙板柔性印刷一模切開槽一釘箱（粘箱），這種工藝符合快速、方便、環保、經濟的原則，目前瓦楞紙柔性版印刷機大多數與壓痕開槽聯動，完成壓痕、開槽、模切、涂膠、制箱、記數等工序。國內瓦楞紙箱的加工大多采用印刷開槽機，該設備由送料、印刷（一次、兩次或更多）、開槽、壓痕、切角、分切、抽廢和堆積等部分組成。

切角開槽安裝主要由上、下滾線輪，上、下開槽刀，上、下切角刀和分切刀等組成，上、下滾線輪主要完成三層瓦楞紙箱的縱壓線，上、下開槽刀通過上部的凸刀切入下部的凹刀完成三層瓦楞紙箱的開縫；上、下切角刀通過上部的切角刀片和下部的刀墊完成瓦楞紙箱接合處的舌頭的成型，分切按規定尺寸進行溜邊修整。

開槽的深度要與箱蓋規格準確配合，一般切口應超過中心壓線，但要小于外雌壓線。